细胞

万字长文，腾讯、清华等多位生物大模型作者专访，畅谈AI生物学，解析大型细胞模型技术

编辑 | KX大型语言模型（LLM）在自然语言处理和理解领域已取得重大突破。在生物学领域，一些采用类似 LLM 结构的大型细胞模型（Large Cellular Model，LCM）被开发用于单细胞转录组学，比如：scBERT、Geneformer、scGPT、scFoundation 和 GeneCompass。这些模型展示了 LCM 在各种生物任务中的应用潜力，并说明了 LCM 彻底改变未来生物学研究的可能性。大型细胞模型的示意图。近日，《Quantitative Biology》期刊采访了一些最具影响力的 L

7/25/2024 2:04:00 PM

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优于人类专家，GPT-4 准确注释单细胞类型，成本低且稳健

编辑 | 萝卜皮GPT-4 是一种专为语音理解和生成而设计的大型语言模型。哥伦比亚大学梅尔曼公共卫生学院（Columbia University Mailman School of Public Health）的 Wenpin Hou 和杜克大学医学院（Duke University School of Medicine）的 Zhicheng Ji 证明，大语言模型 GPT-4 可以在单细胞 RNA 测序分析中使用标记基因信息准确注释细胞类型。「注释单个细胞的细胞类型的过程通常非常耗时，需要人类专家比较跨细胞簇的基

3/28/2024 6:44:00 PM

ScienceAI

单细胞生物学基础大型语言模型scGPT更新版来了，在超3300万个细胞上进行预训练

编辑 | 紫罗就在前不久，多伦多大学研究团队发布首个单细胞生物学基础大型语言模型：scGPT，其在超 1000 万个细胞上进行预训练。现在，该研究团队首次尝试对超过 3300 万个细胞进行生成预训练来更新 scGPT。论文的通讯作者、多伦多大学助理教授 Bo Wang 在推特激动发文：「令人兴奋的 scGPT 更新：自 4 月份发布以来，受到社区的极大关注，我们很高兴地宣布单细胞多组学数据的基础模型 scGPT 的首次重大更新。」更新后的研究以「scGPT: Towards Building a Foundatio

7/5/2023 6:11:00 PM

ScienceAI

首个单细胞生物学基础大型语言模型，在超1000万个细胞进行预训练

编辑 | 紫罗生成式预训练模型在自然语言处理（NLP）和计算机视觉等领域取得了显著的成功。文本是由文字组成的，细胞可以用基因来表征。NLP 和单细胞生物学之间的另一个核心相似之处是，用于训练的公开可用的单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据的规模庞大且不断增长。NLP 模型是否也能理解单细胞生物学的内在逻辑并发展「涌现思维」？近日，来自加拿大多伦多大学和彼得·蒙克心脏中心（Peter Munk Cardiac Centre）的研究人员，通过利用呈指数增长的单细胞测序数据，首次尝试对超过 1000 万个细胞进

5/9/2023 11:29:00 AM

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